喝多的蒙哥被人扶出汉宫，忽必烈冲上去相救，他没想到见到的皇妃正是伊娜，她化名蓝乐丝。哈失被旭烈兀活捉，叛军被全部镇压，忽必烈在救蒙哥时受伤。脱列格那要见蒙哥时被拒绝，她被送回去。海迷失的两个儿子也被检举参与叛乱，蒙哥下令将他们一同处死，脱列格那被软禁。
海迷失因丧失儿子而痛不欲生，她只想见他们最后一面。脱列格那深知上次叛乱让蒙哥怀恨在心，这一次上天也无法改变他们兄弟之间的手足相残。脱列格那的孙子海都因不在和林而逃过一劫，蒙哥答应脱列格那和海迷失与子孙再见一面，失烈门也因此被诛连。
蒙哥命人给哈失掌嘴，黄金家族的人被留全尸，脱列格那和海迷失骑马赶到见到子孙的最后一面，他们抱头痛哭。海迷失和脱列格那在跪在地上向蒙哥求饶，阿里不哥发出行刑的命令，忽必烈想劝说蒙哥时也无济于事，他想用战功来救那些孩子们，蒙哥只让他挑选一个。
哈失等人被卷起来后扔后湖水里，等捞上来时已经全部死去，海迷失和脱列格那失声痛哭，失烈门被忽必烈所救。蒙哥开会商议处理叛军之事，被查出的余孽尚有三百多人，蒙哥将任务交给忽必烈去办，忽必烈明白他的意思，蒙哥将金莲川的土地交给忽必烈管理，还让伊娜赐酒给他。
贴尼知道三百多人的叛军名单在忽必烈手里很沉重，他清楚额吉的良苦用心，忽必烈在具体实行上放宽了对标准，他心怀仁慈只处死了七十余人，蒙哥没想到忽必烈会那样处理乱党。霍赤知道窝阔台家族破落后会受牵连，他被带到蒙哥面前，霍赤对蒙哥吹捧一番，他想要一块水草肥美土地来颐养天年，霍赤也是赌了一把。
建元风云第31集剧情介绍失烈门和海都去看望被软禁的脱烈格那，脱列格那让他们以后不要再来见自己，她让海都此生都在察合台度过，失烈门答应她会跟着忽必烈去金莲川，他相信自己终有一天会重返和林，脱烈格那等孙子走后哭起来。霍赤被人拉入牢笼关押起来，牢笼被扔入水中，霍赤只能等死。蒙哥新政赢得老百姓的拥戴，忽必烈想让蒙哥停止修建汗宫，将省下的钱用于老百姓中，蒙哥答应下来。
蒙哥将训练军队的权力交给阿里不哥，阿里不哥将军队治理的井井有条。伊娜见到忽必烈后问起他的情况，他也不知她何时嫁给蒙哥，伊娜揭下面纱，她自尽后被救起，还是嫁了过去，蒙哥带兵攻打西域时带回她，她现在已是蒙哥侧妃，但在忽必烈心中她仍是以前的伊娜，城墙上马琴的声音让他们想起小时候在一起的情形，两人拥抱在一起时被路过的察比看到。
察比回去后闷闷不乐，忽必烈得知情况后急忙赶回，贴尼和库撒儿不知道是何原因。忽必烈向察比问起原因，察比一声不吭，库撒儿劝她吃些东西，还不时地劝说，察比向库撒儿说起看到忽必烈和伊娜在一起，当库撒儿知道伊娜是汗妃后也很惊讶。忽必烈找蒙哥辞行，他要去漠南和金莲川治理。旭烈兀已按蒙哥的意见处理海迷失，蒙哥是因为忽必烈的劝说才没杀脱列格那和海迷失。
蒙哥也不明白忽必烈为何要救失烈门，他清楚忽必烈是大蒙古的骄傲，也是他解不开的心结。失烈门希望忽必烈和贴尼能原谅脱列格那，他们让失烈门好好照顾脱列格那。忽必烈叫察比吃饭时听她说起伊娜之事，她担心他因此惹来杀身之祸，忽必烈说起向蒙哥辞行后她才理解。蒙哥带着伊娜来到忽必烈府中，他向他们解释起蓝乐丝的事情，蒙哥解释了救出伊娜的原因。
蒙哥在忽必烈离开前多送他马匹和牛羊，忽必烈全部接下，他感觉自己亏欠察比太多，忽必烈答应以后好好补偿她，她了解他的为人，很多事情她都明白。伊娜看到忽必烈离开的背影后知道已无法回到从前，忽必烈回到邢州，刘秉忠心事重重，他提起失烈门，但不知从何说起，他担心蒙哥因失烈门之事会为难忽必烈。
